Fue fundada después de la epidemia de peste de 1477 por dos hermanos de la Cofradía de San Roque. Alberga en su interior el tesoro histórico artístico de la Scuola.
Jacopo Tintoretto trabajó durante casi toda su vida para la Scuola de San Roque, y prácticamente toda la decoración pictórica es obra suya con obras como San Roque (1564), Jesucristo ante Pilatos (1565), Crucifixión (1565), El levantamiento de la serpiente de bronce (1575-1577), María Magdalena (1538-1587) y La huida a Egipto (1583-1587).